I stort sett allt arbete med vatteninfrastruktur är så kallad vattenverksamhet, något man måste ansöka om tillstånd för att bedriva. Tillståndet kan bara lämnas av Mark- och miljödomstolen.
Tillståndsansökan börjar med en samrådsprocess och avslutas med en dom i ärendet:
- Samråden redovisas
Syftet med samråden är att fånga upp synpunkter och idéer. När samråden har genomförts och synpunkter har kommit in ska en samrådsredogörelse, som innehåller protokoll från de olika samråden, skickas till Länsstyrelsen. Länsstyrelsen bedömer sedan om verksamheten kan anses ha en betydande miljöpåverkan eller inte. Om så bedöms vara fallet måste en mer omfattande miljökonsekvensbeskrivning (MKB) göras och samrådet utökas med fler intressenter. - Ärendet prövas, synpunkter kan lämnas
Sedan skickas en ansökan och en eventuell MKB till Mark- och miljödomstolen, som prövar verksamheten. Ansökan kungörs i media. De som önskar har nu möjlighet att lämna synpunkter under en remisstid. Ansökan och MKB skickas också till Länsstyrelsen för bedömning. Den/de som sökt tillståndet får möjlighet att bemöta de synpunkter som kommer in. - Beslut fattas
Prövningen avslutas med ett tillståndsbeslut, en dom från Mark- och miljödomstolen. Domen kan innebära att viss negativ miljöpåverkan accepteras, under förutsättning att tillståndet följs. Länsstyrelsen är tillsynsmyndighet.
Överklagande, men inget prövningstillstånd
Domen i Mark- och miljödomstolen (MMD) den 14 december 2017 om bygget av den nya avloppstunneln överklagades av flera sakägare och av Naturvårdsverket. Miljööverdomstolen beslutade dock att inte ge prövningstillstånd till sakägarna när det gäller bygget av tunneln men däremot till Naturvårdsverkets yrkande på ett tak för fosforutsläpp. Miljööverdomstolens beslut innebär att planeringen och bygget av Stockholms framtida avloppsreningstunnel nu kan gå vidare enligt plan
Mark- och miljödomstolarna
Mark- och miljödomstolarna är särskilda domstolar som bildades 2011. De handlägger mål som till exempel gäller miljö- och vattenfrågor, fastighetsbildning och plan- och byggärenden.
När ett ärende prövas är både den juridiska kompetensen och expertkunskaper inom verksamhetsområdet viktig. Domare dömer därför tillsammans med tekniska råd och särskilda ledamöter. De tekniska råden är anställda vid domstolen och har teknisk eller naturvetenskaplig utbildning. De särskilda ledamöterna tillför sakkunskap inom det område som ärendet gäller. De är inte anställda, utan arbetar på uppdrag. Nämndemän dömer inte i mark- och miljödomstolar.